http://yoshidk6.hatenablog.com/entry/2017/05/24/134934 の続きです。前回使用したモデルを拡張して、複数の被験者からのデータを解析します。解析は以下の手順で行っていきます。 使用する仮想データ 全被験者が同じPKパラメータを持つと仮定 Stanモデル …

RStudio ServerをGoogle Computing Engineで動かす - yoshidk6’s blog に引き続き、VMインスタンスにRStanをインストールします。 以下の記事を参考にしてインストールを進めていきます。 Installing RStan on Mac or Linux · stan-dev/rstan Wiki · GitHub …

モチベーション 家で使っているコンピュータがMacbook Air 2011モデル(1.6GHz Core i5, メモリ2GB)と非常に貧弱で、Stanを動かすのに支障が出ている一方で、特段買いたいパソコンも見当たらないので、クラウドのサーバーを試してみることにしました。AWSにつ…

StanでPopulation pharmacokinetic解析 - yoshidk6’s blog の続きです。 最初のステップとして、一被験者のデータを用いた解析を行います。 (2017/5/27 に、データ・コード含めて更新を行いました。) (2017/10/26 にコードの再更新を行いました。) 使用する…

簡単な薬物動態モデルを使ったPopulation pharmacokinetic (母集団薬物動態) 解析を、練習を兼ねてStanで実装してみました。 項目(予定) 一被験者の薬物動態解析 階層モデルによる複数被験者の薬物動態解析 推定パラメータ間の相関と多変量正規分布 パラメー…